Handlung: Eine Horde von Außerirdischen, die sich Shroobs nennen, wollen ein neues Zuhause und so kommen sie auf die Idee das Pilzkönigreich zu erobern und Prinzessin Peach für ihre Pläne gefangen zu nehmen. Nun liegt es an unseren Helden durch die Zeit zu reisen und so die Vergangenheit und die Gegenwart zu retten.